Novel chimeric proteins mimicking SARS-CoV-2 spike epitopes with broad inhibitory activity

SARS-CoV-2 spike (S) protein mediates virus attachment to the cells and fusion between viral and cell membranes. Membrane fusion is driven by mutual interaction between the highly conserved heptad-repeat regions 1 and 2 (HR1 and HR2) of the S2 subunit of the spike. For this reason, these S2 regions are interesting therapeutic targets for COVID-19. Although HR1 and HR2 have been described as transiently exposed during the fusion process, no significant antibody responses against these S2 regions have been reported. Here we designed chimeric proteins that imitate highly stable HR1 helical trimers and strongly bind to HR2. The proteins have broad inhibitory activity against WT B.1 and BA.1 viruses. Sera from COVID-19 convalescent donors showed significant levels of reactive antibodies (IgG and IgA) against the HR1 mimetic proteins, whereas these antibody responses were absent in sera from uninfected donors. Moreover, both inhibitory activity and antigenicity of the proteins correlate positively with their structural stability but not with the number of amino acid changes in their HR1 sequences, indicating a conformational and conserved nature of the involved epitopes. Our results reveal previously undetected spike epitopes that may guide the design of new robust COVID-19 vaccines and therapies.This work was supported by grants CV20.26565 from the Consejería de Economía y Conocimiento, Junta de Andalucía (Spain), PID2019.107515RB.C21 from the Spanish State Research Agency (SRA/10.13039/501100011033), and co-funded by ERDF/ESF, “A way to make Europe”/“Investing in your future”. The work performed in C.M.'s laboratory was supported by grants from ANRS (Agence Nationale de Recherches sur le SIDA et les hépatites virales), the Investissements d'Avenir program managed by the ANR under reference ANR-10-LABX-77 and EHVA (No. 681032, Horizon 2020). Work in S.B.'s laboratory was supported by grants from the Agence Nationale de la Recherche (ANR) (ANR-11-LABX-0070_TRANSPLANTEX), the INSERM (UMR_S 1109), the Institut Universitaire de France (IUF), all the University of Strasbourg (IDEX UNISTRA), the European Regional Development Fund (European Union) INTERREG V program (project no. 3.2 TRIDIAG) and MSD-Avenir grant AUTOGEN. We are grateful to the Spanish Radiation Synchrotron Source (ALBA), Barcelona, Spain and the European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble, France, for the provision of time and staff assistance at XALOC (ALBA) and ID30B and ID23-2 (ESRF) beamlines during diffraction data collection. We thank María Carmen Salinas-García for her assistance in carrying out the crystallization screenings. We also thank Pilar González-García for helping us with the statistical analysis

The State of the Art in Multilayer Network Visualization

Modelling relationships between entities in real-world systems with a simple graph is a standard approach. However, reality is better embraced as several interdependent subsystems (or layers). Recently the concept of a multilayer network model has emerged from the field of complex systems. This model can be applied to a wide range of real-world datasets. Examples of multilayer networks can be found in the domains of life sciences, sociology, digital humanities and more. Within the domain of graph visualization there are many systems which visualize datasets having many characteristics of multilayer graphs. This report provides a state of the art and a structured analysis of contemporary multilayer network visualization, not only for researchers in visualization, but also for those who aim to visualize multilayer networks in the domain of complex systems, as well as those developing systems across application domains. We have explored the visualization literature to survey visualization techniques suitable for multilayer graph visualization, as well as tools, tasks, and analytic techniques from within application domains. This report also identifies the outstanding challenges for multilayer graph visualization and suggests future research directions for addressing them

Le transport des gammagraphes

Au 31 décembre 2008, les transports par route des gammagraphes seront réalisés selon toutes les prescriptions de la classe 7 de la réglementation des transports des matières dangereuses par route (A.D.R.). En effet les dispositions particulières de l'article 28 de "l'arrêté ADR modifié" du 1er juin 2001, qui leurs étaient réservées ne seront plus applicables. Ce document présente les contrôles radiologiques à réaliser sur le gammagraphe et le véhicule et souligne les règles pour l'étiquetage le marquage et la signalisation, ainsi que les documents qu'il est nécessaire de trouver à bord du véhicule. Il aborde les exigences qui permettent une intervention efficace en cas d'accident de transport

Les supraconducteurs en courant alternatif

Since 1983, when the very first AC wire became available, the comprehension of electromagnetic phenomenas ruling over stability and losses of multifilamentary superconductors in AC use, has much improved. Improvements of manufacturing process has opened up the possibility of industrial scale manufacturing of up to one million, 140 nm in diameter, filaments. The AC loss performances and stability remains at the best level up to date.Les premiers brins supraconducteurs utilisables en courants alternatifs sont apparus en 1983. Depuis, des progrès importants ont été réalisés sur le plan de la compréhension des phénomènes électromagnétiques commandant les pertes et la stabilité dans des brins multifilamentaires à filaments ultrafins. L'amélioration des performances et des procédés de fabrication nous permet aujourd'hui de présenter des brins, fabriqués à l'échelle industrielle, comprenant jusqu'à près d'un million de filaments de 140 nm de diamètre, avec des niveaux de pertes et de stabilité inégalés à ce jour

Dispositif de mesure de pertes dans les conducteurs supraconducteurs utilisés en régime variable

Un dispositif expérimental, pour mesurer les pertes générées dans les conducteurs supraconducteurs utilisés en régime alternatif 50 Hz, est décrit. La méthode, basée sur le principe thermométrique, consiste à isoler l'échantillon du bain d'hélium par une résistance thermique. La puissance dissipée est déterminée à l'aide de deux sondes de température disposées de part et d'autre de la résistance. L'étalonnage de la mesure est assuré par une chaufferette. La précision des mesures est de 10% pour des pertes linéiques supérieures à 2 mW/m

DYNAMIQUE DES POPULATIONS DE DIAPREPES ABBREVIATUS, CHARANCON DES AGRUMES, EN MARTINIQUE ET CONTROLE BIOLOGIQUE EN PEPINIERE PAR DES NEMATODES ENTOMOPARASITE

Un important ravageur de Citrus et de Canne à sucre aux Antilles : Diaprepes abbreviates (L.) a récemment été signalé dans 500 hectares de Citrus en Guadeloupe et en Martinique. La dynamique de population de ce ravageur a été suivie de Mai 1986 à Mai 1989. Cette étude montre que Diaprepes abbreviatus est présent tout au long de l'année avec un maximum de pontes de Mars à Juin. La virulence de 2 souches de nématodes entomoparasites (Neoaplectan a et Heterorhabditis) vis à visdes larves de Diaprepes a été comparé en pépinière. La mortalité importante des larves (94,5 %) a été obtenue avec Heterorhabditis . Ce résultat encourageant montre que les nématodes entomoparasites sont des candidats intéressants pour le contrôle biologique de Diaprepes abbreviatus dans les pépinières de Citrus. ----- The so-called surgacane rootstalk borer weevil, Diaprepes abbreviatus(L) an important pest of citrus and sugarcane in the West Indies was recently found infesting 500 hectares of citrus in Guadeloupe and Martinique. Population dynamic of this pest has been followed from May 1988 to May 1989. It shows that Diaprepes abbreviatus is present throughout the year with a maximum of eggs laying from March to June. The pathogenicity of two strains of entornophilic nematodes (Neapiectana and Heterorhabditis) to Diaprepes larvae has been compared in nursery. The highest grub mortality (94,5 %) was obtained with Heterorhabditis. This encouraging result show that entornophilic nematodes are interesting candidates for biological control of Diaprepes abbreviatus in citrus nurseries